1949年3月,一架B-36B创造了43小时37分飞行15450千米的航程纪录,其中有8047千米是挂着4500千克炸弹飞行的。这架飞机从沃斯堡横穿美国飞到蒙大拿州明尼阿波利斯大瀑布,然后转向佛罗里达州基韦斯特,杜鲁门总统正在此地度假。在返航途中B-36B把炸弹扔在了墨西哥湾,然后飞回大瀑布,再经由华盛顿州斯波坎返回沃斯堡。
1950年9月,最后一架B-36B交付。
B-36B的体重从一开始就在不断增长,这对性能产生了不利影响。遥控炮塔和20毫米机炮十分复杂,故障频发。这套自卫武器系统是通用电气公司设计制造的,一开始由于炮塔和机炮存在缺陷而推迟交付,导致B-36A出厂时没有安装自卫武器。炮塔交付并安装完毕后却又因为缺少20毫米弹药导致武器测试被推迟到1949年中期。甚至到了1950年2月,第8空军的指挥官还在抱怨许多B-36B的机炮无法正常射击。
B-36B在服役之初遭遇的许多问题对于复杂的新飞机来说并不稀奇,由于零部件短缺,轰炸机部队在要紧关头只能拆卸一些B-36B的零件来维持其他B-36B的飞行。此外,该机的尾部支架、推车和千斤顶之类的地面支援设备也一直供不应求。B-36B机队本身也处在不断改装的状态中,飞机不是在进行升级就是在等待改装,实际上直到1952年这些飞机才达到完全的作战能力。
出于各种原因,B-36B机队直到1952年才达到完全的作战能力 康维尔共制造了73架B-36B,其中64架被升级为B-36D,在外翼段下方增加了4台通用电气J47-GE-19涡喷发动机,1952年重新交付美国空军,编号改为B-36D或RB-36D。
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