模拟器
模拟器最初被引入飞行员训练课程中是为了模拟在真实飞行中不安全或不可能模拟的紧急情况。但随着模拟器技术的进步和飞涨的燃油成本，使用模拟器进行作战训练也更符合成本效益。
为了促进F-16I的换装训练，2006年1月4日，“雷暴”训练中心从拉蒙搬迁至负责以色列空军所有F-16训练的哈措尔空军基地。随后在1月18日，洛克希德·马丁公司宣布获得了一份价值1.8亿美元的新“雷暴”模拟器合同，5天后，埃尔比特公司透露了一个1亿美元合同，为模拟器提供航电仿真、驾驶舱和视觉系统。
新模拟器系统在2008年5月11日落成，被用于训练飞行员处理紧急情况以及在恶劣天气条件下的飞行，并用于部分教学大纲课程训练。以色列空军认为模拟器作为“雷暴”机组培训课程的一个组成部分，可以节省燃料和压低开支，提高安全性并改善机组执行任务的能力。
F-16I的球幕模拟器
任务训练中心
在进一步发展下，以色列空军在2008年宣布了在哈措尔建设一个新的任务训练中心的计划。埃尔比特公司被授予了一份15年期的5.5亿美元私人融资计划合同，对该中心进行开发、建设和经营。
中心被设计成可以连接多台模拟器，以及一个模拟的地面控制站，可以更加真实地模拟出双机、4机乃至8机编队任务。
2012年5月30日，埃尔比特公司又获得另一份价值3000万美元的合同，把“雷暴”模拟器与F-15I模拟器连接起来进行各种任务场景的训练。该合同还包括把“雷暴”模拟器和训练以色列国防军直升机飞行员、无人机操作员和地面部队的模拟器连接起来。
该系统将能提供可负担的实战场景训练，即使学员彼此相距遥远，也能联网一起训练。这个任务训练中心在2013年12月19日正式建成。
中期寿命升级
2009年2月1日，所有102架“雷暴”交付完毕，最后四架降落在哈则瑞姆。
F-16I机队已经发生了两起训练事故，第一起发生在2010年11月10日夜间，第119中队的“雷暴”480坠毁，导致两名机组遇难。第二起发生在2013年7月13日，第107中队的“雷暴”107在地中海上空因严重的发动机故障而坠毁。加上2006年的那起起飞事故，F-16I机队的数量减少到了99架，每起事故都导致了至少4400万美元的损失。
“雷暴”480“生前”照片
“雷暴”107残骸打捞
F-16I目前还相对较新，预计在2019-2024年间会迎来中期寿命升级。在过去，以色列空军在用新一代战斗机的技术来升级老型号方面一直做得不错，例如在21世纪初使用了“雷暴”的技术升级了F-16C/D“闪电”（Barak）。所以人们预计来自F-35A“强大”（Adir）的技术也会被用于F-16I的中期寿命升级。目前，F-16I在开始交付12年后，仍然是以色列空军中最现代化的作战飞机。
目前，F-16I在开始交付12年后，仍然是以色列空军中最现代化的作战飞机